MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Mesorhizobium loti MAFF303099 chromosome

Total Repeats: 18194

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1001	NC_002678	GTG	2	6	362395	362400	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1002	NC_002678	GCT	2	6	362427	362432	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1003	NC_002678	GTCGG	2	10	362454	362463	0 %	20 %	60 %	20 %	Non-Coding
1004	NC_002678	TCC	2	6	362502	362507	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1005	NC_002678	CG	3	6	362916	362921	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1006	NC_002678	GC	4	8	362922	362929	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1007	NC_002678	GCA	2	6	363987	363992	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1008	NC_002678	TTGGCT	2	12	364009	364020	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	Non-Coding
1009	NC_002678	AAT	2	6	364030	364035	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1010	NC_002678	C	6	6	364895	364900	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
1011	NC_002678	GC	3	6	365668	365673	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1012	NC_002678	TTCGGC	2	12	366126	366137	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1013	NC_002678	CGG	3	9	366146	366154	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1014	NC_002678	TGTC	2	8	366203	366210	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1015	NC_002678	GCG	2	6	366211	366216	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1016	NC_002678	GCC	2	6	366982	366987	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1017	NC_002678	CG	3	6	367048	367053	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1018	NC_002678	CT	3	6	369614	369619	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1019	NC_002678	TTTTTG	2	12	369645	369656	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
1020	NC_002678	GCC	2	6	373326	373331	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1021	NC_002678	CGG	2	6	373407	373412	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1022	NC_002678	TGG	3	9	373448	373456	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1023	NC_002678	GTC	2	6	378732	378737	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1024	NC_002678	AGGCCA	2	12	378751	378762	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1025	NC_002678	A	6	6	378769	378774	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1026	NC_002678	AAT	2	6	379475	379480	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1027	NC_002678	TGA	2	6	379608	379613	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1028	NC_002678	ATC	2	6	379660	379665	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1029	NC_002678	CGC	2	6	382773	382778	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1030	NC_002678	CGAT	2	8	382785	382792	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1031	NC_002678	GTG	2	6	382835	382840	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1032	NC_002678	CGGT	2	8	382932	382939	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1033	NC_002678	A	6	6	382966	382971	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1034	NC_002678	GC	3	6	383039	383044	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1035	NC_002678	TTG	2	6	383073	383078	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1036	NC_002678	AACAA	2	10	383218	383227	80 %	0 %	0 %	20 %	Non-Coding
1037	NC_002678	A	6	6	383226	383231	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1038	NC_002678	CAC	2	6	385242	385247	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1039	NC_002678	GCA	2	6	385258	385263	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1040	NC_002678	CGG	2	6	385264	385269	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1041	NC_002678	CGG	2	6	385271	385276	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1042	NC_002678	CTCA	2	8	385315	385322	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1043	NC_002678	GC	3	6	385342	385347	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1044	NC_002678	CCG	2	6	385442	385447	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1045	NC_002678	CCG	2	6	386884	386889	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1046	NC_002678	CGG	3	9	386901	386909	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1047	NC_002678	TGCC	2	8	386927	386934	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1048	NC_002678	GGC	2	6	388370	388375	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1049	NC_002678	GCC	2	6	388410	388415	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1050	NC_002678	AAAAG	2	10	388423	388432	80 %	0 %	20 %	0 %	Non-Coding
1051	NC_002678	TGC	2	6	389855	389860	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1052	NC_002678	GCCG	2	8	389898	389905	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1053	NC_002678	TTGC	2	8	389963	389970	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1054	NC_002678	CGC	2	6	389978	389983	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1055	NC_002678	GGAT	2	8	390019	390026	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1056	NC_002678	CAA	2	6	390720	390725	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1057	NC_002678	CCG	2	6	390731	390736	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1058	NC_002678	CCGG	2	8	390797	390804	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1059	NC_002678	CCA	2	6	390916	390921	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1060	NC_002678	GCG	2	6	390970	390975	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1061	NC_002678	AACC	2	8	391030	391037	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
1062	NC_002678	TGCC	2	8	392274	392281	0 %	25 %	25 %	50 %	Non-Coding
1063	NC_002678	CTGA	2	8	392306	392313	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1064	NC_002678	AGA	2	6	395757	395762	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1065	NC_002678	TGG	2	6	396396	396401	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1066	NC_002678	CG	3	6	396415	396420	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1067	NC_002678	GGA	2	6	396425	396430	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1068	NC_002678	CGGCC	2	10	397658	397667	0 %	0 %	40 %	60 %	Non-Coding
1069	NC_002678	GGCGC	2	10	397671	397680	0 %	0 %	60 %	40 %	Non-Coding
1070	NC_002678	CG	3	6	397734	397739	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1071	NC_002678	ATCC	2	8	397822	397829	25 %	25 %	0 %	50 %	Non-Coding
1072	NC_002678	ATA	2	6	397848	397853	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1073	NC_002678	TG	3	6	398981	398986	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1074	NC_002678	ACG	2	6	398995	399000	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1075	NC_002678	CGC	2	6	399393	399398	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1076	NC_002678	AAC	2	6	399426	399431	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1077	NC_002678	TA	3	6	399516	399521	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
1078	NC_002678	T	6	6	400553	400558	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1079	NC_002678	CTTG	2	8	401132	401139	0 %	50 %	25 %	25 %	Non-Coding
1080	NC_002678	CCG	3	9	401144	401152	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1081	NC_002678	GCC	2	6	401618	401623	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1082	NC_002678	CGG	2	6	402702	402707	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1083	NC_002678	GGT	2	6	403891	403896	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1084	NC_002678	T	6	6	403908	403913	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1085	NC_002678	GCGG	2	8	403941	403948	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
1086	NC_002678	ACG	2	6	403981	403986	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1087	NC_002678	AG	3	6	404000	404005	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1088	NC_002678	CGG	2	6	404813	404818	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1089	NC_002678	CCG	2	6	404828	404833	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1090	NC_002678	CAC	2	6	406442	406447	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1091	NC_002678	GCG	2	6	409153	409158	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1092	NC_002678	CCGC	2	8	409159	409166	0 %	0 %	25 %	75 %	Non-Coding
1093	NC_002678	AAGA	2	8	409713	409720	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
1094	NC_002678	CTC	2	6	411591	411596	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1095	NC_002678	GCG	2	6	411601	411606	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1096	NC_002678	CCG	2	6	411614	411619	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1097	NC_002678	GGTT	2	8	411659	411666	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
1098	NC_002678	GC	3	6	411703	411708	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1099	NC_002678	TGCGT	2	10	414318	414327	0 %	40 %	40 %	20 %	Non-Coding
1100	NC_002678	GA	3	6	414464	414469	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
1101	NC_002678	TC	3	6	416602	416607	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1102	NC_002678	GC	3	6	416609	416614	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1103	NC_002678	A	6	6	416629	416634	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
1104	NC_002678	TGC	2	6	416898	416903	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1105	NC_002678	GTCCA	2	10	416924	416933	20 %	20 %	20 %	40 %	Non-Coding
1106	NC_002678	TC	3	6	416943	416948	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
1107	NC_002678	CAAT	2	8	416983	416990	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
1108	NC_002678	TAGG	2	8	417044	417051	25 %	25 %	50 %	0 %	Non-Coding
1109	NC_002678	AAT	2	6	419067	419072	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1110	NC_002678	TTTC	2	8	419089	419096	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
1111	NC_002678	GCC	2	6	419101	419106	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	Non-Coding
1112	NC_002678	TAA	2	6	419118	419123	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1113	NC_002678	GGC	2	6	419200	419205	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1114	NC_002678	TAA	2	6	419210	419215	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1115	NC_002678	TTC	2	6	419229	419234	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
1116	NC_002678	ATA	2	6	419240	419245	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
1117	NC_002678	TATT	2	8	419282	419289	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
1118	NC_002678	T	6	6	419310	419315	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
1119	NC_002678	GAA	2	6	419338	419343	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1120	NC_002678	TGGC	2	8	419428	419435	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1121	NC_002678	GTCG	2	8	419464	419471	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1122	NC_002678	TGT	2	6	419489	419494	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1123	NC_002678	CTC	2	6	419497	419502	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1124	NC_002678	GCG	2	6	425888	425893	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1125	NC_002678	GCT	2	6	425913	425918	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1126	NC_002678	GCCG	2	8	426050	426057	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
1127	NC_002678	TCGG	2	8	426061	426068	0 %	25 %	50 %	25 %	Non-Coding
1128	NC_002678	GGC	2	6	426071	426076	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
1129	NC_002678	GAA	2	6	426083	426088	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1130	NC_002678	CCT	2	6	426223	426228	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1131	NC_002678	CAC	2	6	426269	426274	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
1132	NC_002678	GTT	2	6	426322	426327	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1133	NC_002678	TCGA	2	8	426370	426377	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1134	NC_002678	TGAC	2	8	426484	426491	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
1135	NC_002678	ATG	2	6	426496	426501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
1136	NC_002678	CGA	2	6	426545	426550	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1137	NC_002678	AGG	2	6	426553	426558	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
1138	NC_002678	CGA	2	6	426560	426565	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
1139	NC_002678	TG	3	6	426572	426577	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
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1173	NC_002678	GCG	2	6	441275	441280	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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1268	NC_002678	GGC	2	6	495078	495083	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
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